事務局組織図
総務課
総務企画グル－プ
理事会・総会、会務運営の総合企画、中期経営計画の進行管理および見直し、予算編成、予算執行、国および県の補助金申請・実績報告、国保中央会・県・地方協議会との連絡調整、市町担当課長協議会、支部運営の連絡調整、個人情報保護、規約・規則の制定改廃、連合会事業の企画、調査関係業務、広報（機関誌・ホームページ等）、融資制度、職員の研修・表彰、職員の給与・福利厚生、負担金・手数料の調定、契約、書籍等の斡旋、「国保新聞」の配布に関すること
出納グル－プ
監事会、決算、収入、支出の審査および出納業務、外部監査、財務・物品の出納、財産・資産の管理運用、その他会計事務に関すること
業務課
情報システムグループ
保険者事務電算共同処理事業、国保総合システムの導入・運用、新・保険者共同電算処理システム、レセプト電算処理システム、オンライン請求システム、後期高齢者医療審査支払システム、後期高齢者医療電算処理システム、診療報酬請求、医療情報データベースシステム、国保連医療保険ネットワークシステム、保険者・国保連合会オンラインネットワーク、医療費統計、共同事業推進委員会の企画・運営、福祉医療費電算共同処理事業に関すること
保険者支援グループ
保険者協議会、保健事業の企画・運営、特定健診・特定保健指導、保険財政共同安定化事業、高額医療費共同事業、国保診療施設関係事務、第三者行為損害賠償求償事務共同処理事業、市町保健師研究協議会、国保財政診断支援事業、保険運営安定化対策事業、在宅保健師派遣事業、「和の会」（在宅保健師の会）、中央会補助事業（保健事業）等企画・推進、広報機材等の貸出・管理、医療費分析・疾病分類統計に関すること
審査課
審査第1グループ（担当地区：小浜市、鯖江市、奥越地区、坂井地区、池田町、南越地区、嶺南地区）
診療報酬（医科・歯科・調剤）の審査、審査課庶務、全国決済業務、過誤調整・返還金業務、審査課の文書管理、審査課日程業務、審査委員会審査状況、レセプト電算処理システム・オンライン請求システムに関すること
審査第2グループ（担当地区：福井市、敦賀市、越前市）
診療報酬（医科）の審査、柔整・鍼灸・訪問看護・療養費等の審査、審査受付業務、診療報酬支払、診療報酬審査委員会の運営、保険医療機関の登録・異動および調整、減額査定分医療費通知、諸様式等の作成・管理、機関紙「審査情報」、レセプト電算処理システム・オンライン請求システム、出産育児一時金等に関すること
再審査・高額審査グループ
再審査事務に関すること、再審査に係る関係機関との連絡調整、再審査・高額審査及び査定率向上に係る統計・分析、専任審査会（常務処理）に関すること
介護障害グル－プ
介護保険審査支払事業、介護給付費審査委員会の運営、市町担当課長協議会（介護保険部会）の企画・運営、介護保険共同事業推進委員会の企画運営、介護サービス苦情処理事業、介護保険電算共同処理事業、障害者自立支援給付支払事業、年金からの特別徴収経由機関業務、機関紙「介護だより」に関すること
